IIS 6.0で「既定の FTP サイト」をユーザー分離モードに変更する方法

すみませんが試せていないので、本当にできるのか問題ないのかわかりません。

IIS 6.0でユーザー分離モードを使うと、ユーザー別に異なるFTPホームを割り当てることができます。
このユーザー分離モードはFTPサイトを作成する際のウィザードに答える格好で構成するのが一般的ですが、これだと「既定の FTP サイト」のままでは使うことができません(Active Directoryを使うユーザ分離モードはiisftp.vbsスクリプトを使って後からでも構成できます)。
また新しく作成するサイトには”Metabase Path”というランダムな値が振られ、ログファイルディレクトリなどに使われるので、構成管理上ちょっと気持ちが悪いです。

この「ユーザー分離モード」という状態は、メタベースという情報に記録されているので、こちらを設定すれば規定のFTPサイトでもユーザー分離モードに変更することができそうです。
UserIsolationMode メタベース プロパティ (IIS 6.0)

C:\WINDOWS\System32\inetsrv\MetaBase.xmlには「既定の FTP サイト」というServerCommentの設定が含まれているので、そちらにUserIsolationMode="1"を追加してあげればいいはず。

<IIsFtpServer	Location ="/LM/MSFTPSVC/1"
		ServerAutoStart="TRUE"
		ServerBindings=":21:"
		ServerComment="既定の FTP サイト"
		ServerSize="1"
                UserIsolationMode="1"
	>

IIS 6.0からメタベースがバイナリ形式からXML形式に変わってので楽になりました。

なおメタベース編集をIIS稼働中におこなう場合は、IIS管理マネージャのプロパティで「メタベースの直接編集を有効にする」をチェックする必要があると思われます。